冷冻式干燥机应安装在环境温度为2-45℃，四周通风良好，空气洁净的建筑物内；特别是避免空气中含有腐蚀类成份（如氨）。当室内机房通风条件不良时，需在机房内安装换气排风设备。
冷干机与空压机之间至少有4-5米的距离，以防止空压机产生的振动影响冷干机正常运行。
风冷型冷干机的进风口与墙体距离1.5m以上，两台干燥机的进风口与排风口不能面对面。冷干机四周应留有一定的空间，以方便维修和日常维护。
水冷式超低温真空冷冻干燥机对环境温度不敏感，不过它对冷却水的要求更高，但水冷式的安装较风冷式复杂；冻干机起源于19世纪20年代的真空冷冻干燥技术经历了几十年的起伏和徘徊后，在的20年中取得了长足进展。主机与真空泵之间由真空管连接，连接处采用卡箍。卡箍内含一只密封橡胶圈，连接前可在橡胶圈上涂抹适量真空脂，再用卡箍卡紧。
与水冷式超低温真空冷冻干燥机相比，风冷式超低温真空冷冻干燥机对环境要求较高，但安装方便、使用简单。冻干机起源于19世纪20年代的真空冷冻干燥技术经历了几十年的起伏和徘徊后，在的20年中取得了长足进展。但是也有一部分水雾在经过过滤器时被集中和除去。冷冻干燥机过滤器的主要作用是过滤压缩空气中的固体颗粒。
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